克莱蒙森大学最好的学系是电子工程，计算机工程的研究院课程，更是全美规模最大。大学的农科是历史最悠久和最优秀的学科。此外，建筑系也很有名气，挑选学生十分严格。如果学生成绩优异，可获选为荣誉学位生。

克莱蒙森大学设有农林和生命科学学院、建筑、艺术与人文学院、商业与公共事务学院、工程与科学学院健康、教育与人类发展学院等五个学院，提供70多个学士学位项目和100个硕士学位项目。

研究一直是克莱蒙森大学教育的重要部分，尤其是机械艺术与科学系的实验教学与培训驰誉美国。其机械工程系在汽车科技研发表现杰出并得到德国BMW汽车公司赞助合作成立研究中心。克莱蒙森大学国际汽车研究中心(CU-ICAR)坐落于南卡罗来纳州格林维尔市，为该校车辆工程专业提供硕士、博士教育。宝马、微软、IBM、博世(BOSCH)、铁姆肯(TIMKEN)和米其林(MICHELIN)是研究中心的主要合作伙伴。学生选修最多的学科，依次是商科管理、工程、师范教育、社会科学和农科。